Complete and Improve epi time functions

[GeraldineGomez]

• Unificar los resultados en la tabla esperada de las funciones que ya procesan las bases y me dan la distribución de casos por semana epi por cada uno de los virus, porcentaje de positividad.

• Guardar la tabla unificada, formato (RDS), en la carpeta de data, con el menor tamaño posible

• Como se van a gestionar esos resultados parciales dentro de la gráfica

• Como se va a leer la tabla unificada para poder generar la grafica

Criterios de aceptación

1. No deben ir variables en mayúscula.
2. Se debe crear una o más funciones en el tema para obtener los atributos de la gráfica, como colores, anchos, etc.
3. Se deben poner los títulos y leyendas en el archivo de configuración del paquete.
4. Añadir parámetros de entrada para obtener el rango de años en los que se debe generar la gráfica.
5. Optimizar la complejidad algorítmica de get_all_tables .
6. Escribir el código en ingles.
7. No usar data, table o palabras reservadas que utiliza R u otros paquetes. Se puede usar: dataset.
8. Mover la función remove_na_rows a el script de utils.R.
9. Añadir en la plantilla del boletín los parámetros para obtener la gráfica.
10. Realizar las pruebas unitarias de tu función, ir revisando: https://testthat.r-lib.org/.
11. Documentar las funciones correctamente.

Fecha primera entrega: 10/12/2024

Ayudas

  config_path <- system.file("extdata", "config.yml", package = "labrep")
  column_names <- config::get(file = config_path, "legends")$epitime[1]